职 称：教授

学 历：博士

E-mail:senliu@hbut.edu.cn

研究方向：蛋白质结构、功能和相互作用网络动力学；药物筛选与设计；系统与合成生物学

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工作经历：

2018年3月至今：湖北工业大学，南湖学者特聘教授

2013年7月—2018年8月：三峡大学，教授

2012年8月—2013年7月：三峡大学，副教授

2011年1月—2012年7月：三峡大学，讲师，校聘副教授

2007年7月—2008年4月: 三峡大学，讲师，校聘副教授

学习经历：

2014年9月—2015年8月：美国匹兹堡大学，药学与化学生物学系，国家公派访问学者

2008年4月—2010年12月: 美国加州大学（旧金山），定量生物学研究所，博士后

2002年9月—2007年7月: 北京大学，理论（定量）生物学中心，硕博连读、博士

1998年9月—2002年7月: 三峡大学，化学与生命科学学院，工学学士

荣获奖励：

2019年9月，湖北省“全省爱岗敬业好青年”

2018年9月，湖北省科学技术进步奖三等奖，“多胺代谢途径作为靶标在抗肿瘤治疗中的应用”

2017年1月，宜昌市“优秀青年科技工作者”

2016年12月，湖北省科学技术学会/人力资源和社会保障厅/科学技术厅，湖北省第十六届自然科学优秀学术论文奖，三等奖

2014年11月，首批湖北省“青年英才开发计划”

2014年5月，三峡大学“十大杰出青年”

2012年3月，湖北省相关人才项目

2011年9月，三峡大学“优秀教师”

2010年8月, 国际蛋白质协会第24届年会，Protein Science Young Investigator Travel Grant / The Protein Society Finn World Travel Award

2007年7月，北京大学“优秀博士论文”

2007年7月，北京大学“优秀毕业生”

2007年5月，北京大学“五四奖学金”

2005年10月，The 4th National Conference of Chemical Biology and the International Symposium on the Interdisciplinary Science of Chemistry with Biology and Medicine，“蓝月亮”优秀墙报奖

2002年7月, 三峡大学“优秀毕业生”

社会兼职：

Rosetta Commons国际蛋白质设计联盟PI团队成员，湖北省生物信息学会发起人之一及副理事长，湖北省生物化学与分子生物学学会理事，农业生物信息学湖北省重点实验室（华中农业大学）学术委员会委员。The Wellcome Trust/ DBT India Alliance, NSFC自科基金等评审人；SCI期刊Protein Expression and Purification，Journal of Bioscience and Bioengineering，Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening等审稿人。

宜昌市侨联副主席，欧美同学会•中国留学人员联谊会第六期全国归国留学人员代表人士（全国共计82人）延安干部学院高级研修班学员（2014年6月）。

研究方向：

主要是结合传统实验手段与计算机方法，利用交叉学科手段，从事蛋白质结构与功能研究、蛋白质设计、药物筛选与设计等。具体包括：

1.蛋白质相互作用网络的研究、改造、设计和药物干预

2.药物（包括小分子、多肽、抗体、功能蛋白）的筛选、优化和设计

3.计算生物学与生物医学信息学分析研究

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研究课题：

1.国家自然科学基金面上项目（31971150 ，2020年-2023年）

2.国家自然科学基金面上项目（31670768，2017年-2020年）

3.国家自然科学基金重大研究计划项目（91330113，2014年-2016年）

4.国家自然科学基金青年基金项目（21103098，2012年-2014年）

5.湖北省杰出青年基金（2019CFA069，2019年-2022年）

6.湖北省相关人才项目启动基金（2012年-2015年）

7.湖北省教育厅自然科学研究计划重点项目（D20161204，2016年-2017年）

8.湖北省首批“青年英才开发计划”项目（2015年-2017年）

9.武汉市科技局应用基础前沿专项（2018060401011319，2018年-2020年）

10.湖北工业大学高层次人才科研启动基金（2018年-2025年）

11.北京分子科学国家实验室开放课题（2012年-2014年）

12.国家863项目协作项目（2005AA235070，2007年-2008年）

研究成果：

1.Polyamines disrupt the KaiABC oscillator by inducing protein denaturation. Jinkui Li#, Lingya Zhang, Junwen Xiong, Xiyao Cheng, Yongqi Huang, Zhengding Su, Ming Yi*, Sen Liu*. Molecules, 2019, 24(18): 3351.

2.Intrinsically Disordered Transactivation Domains Bind to TAZ1 Domain of CBP via Diverse Mechanisms. Meng Gao#, Jing Yang, Sen Liu, Zhengding Su, Yongqi Huang*. Biophysical Journal, 2019, 117(7): 1301-1310.

3.Structure-based reconstruction of a Mycobacterium hypothetical protein into an active Δ5–3-ketosteroid isomerase. Fei Peng#, Xiyao Cheng, Hongwei Wang, Shikui Song, Tian Chen, Xin Li, Yijun He, Yongqi Huang, Sen Liu, Fei Yang*, Zhengding Su*. BBA – Proteins and Proteomics, 2019, 1867(9): 821-830.

4.Recombinant butelase-mediated cyclization of the p53-binding domain of the oncoprotein MdmX stabilized protein conformation as a promising model for structural investigation. Ni Pi#, Meng Gao, Xiyao Cheng, Huili Liu, Zhengkun Kuang, Zixin Yang, Jing Yang, Bailing Zhang, Yao Chen, Sen Liu, Yongqi Huang, Zhengding Su*. Biochemistry, 2019, 58(27): 3005-3015.

5.The influence of intrinsic folding mechanism of an unfolded protein on the coupled folding-binding process during target recognition. Junwen Xiong#, Meng Gao, Jingjing Zhou, Sen Liu, Zhengding Su*, Zhirong Liu, Yongqi Huang*. Proteins: Structure, Function, Bioinformatics, 2019, 87(4): 265-275.

6.The reversible function switching of the circadian clock protein KaiA is encoded in its structural flexibility via 3-D domain swapping. Qiang Chen#, Sen Liu*, Liting Yang, Lingya Zhang, Jinkui Li. BBA-General Subjects, 2017, 1861(11): 2535-2542. (IF=4.722)

7.3D-quantitative structure–activity relationship and docking studies of coumarin derivatives as tissue kallikrein 7 inhibitors. Xin Zheng#, Mengxi He#, Xiao Tan*, Jun Zheng, Fangyu Wang, Sen Liu*. Journal of Pharmacy and Pharmacology, 2017, 69(9): 1136-1144. (IF=2.405)

8.Discovery of covalent ligands via noncovalent docking by dissecting covalent docking based on a “steric-clashes alleviating receptor (SCAR)” strategy. Yuanbao Ai#, Lingling Yu#, Xiao Tan#, Xiaoying Chai, Sen Liu*. Journal of Chemical Information and Modeling, 2016, 56(8): 1563-1575. (IF=3.738)

*** 封面论文

9.A dynamic interaction process between KaiA and KaiC is critical to the cyanobacterial circadian oscillator. Pei Dong#, Ying Fan, Jianqiang Sun, Mengting Lv, Ming Yi, Xiao Tan, Sen Liu*. Scientific Reports, 2016, 6: 25129. (IF=5.578)

10.Discovery of Novel Inhibitors of Human S-Adenosylmethionine Decarboxylase Based on in silico High-throughput screening and a Non-radioactive Enzymatic Assay. Chenzeng Liao#, Yanlin Wang, Xiao Tan, Lidan Sun, Sen Liu*. Scientific Reports, 2015, 5: 10754. (IF = 5.578)

11.Reliable cell cycle commitment in budding yeast is ensured by signal integration. Xili Liu#, Xin Wang#, Xiaojing Yang, Sen Liu, Lingli Jiang, Yimiao Qu, Lufeng Hu, Qi Ouyang, Chao Tang*. eLife 2015, 4: e03977. (IF = 9.322)

12.The P2/P2' Sites Affect the Substrate Cleavage of TNF-alpha Converting Enzyme (TACE). Sen Liu#*, Song Liu, Yanlin Wang, Zhaojiang Liao. Molecular Immunology, 2014, 62(1): 122-128. (IF = 2.973)

13.Control of Protein Signaling Using a Computationally Designed GTPase/GEF Orthogonal Pair. Gregory T. Kapp#, Sen Liu#, Derek T. Wong, Attila Reményi, Brian Yeh, Jack Taunton, Wendell A. Lim, and Tanja Kortemme*. Proc. Natl. Acad Sci USA, 2012, 109(14): 5277-5282. (IF = 9.674)

*** 封面推荐.

*** 专评: PNAS April 3, 2012 vol. 109 no. 14: 5140-5141.

14.Nonnatural protein–protein interaction-pair design by key residues grafting. Sen Liu#, Shiyong Liu#, Xiaolei Zhu, Huanhuan Liang, Aoneng Cao, Zhijie Chang, Luhua Lai*. Proc. Natl. Acad Sci USA 2007, 104(13): 5330-5335. (IF = 9.674)

15.免疫学实验进展. 刘森，“免疫信息学”。 章晓联主编，中华医学会中华医学电子音像出版社，《中国医学研究发展系列报告》丛书，2018年6月，ISBN：978-7-83005-171-6.

16.分子印记技术. 刘朝奇、王艳林、刘森主编. 化学工业出版社, 2012年2月, ISBN 978-7-122-11645-1.

17.PCR聚合酶链反应. 刘森主编. 化学工业出版社, 2009年1月, ISBN 978-7-122-03138-9.

18.ZL 200510086708.4，具有促红细胞生长因子活性 蛋白质及其用途，2008.11.12。发明人：来鲁华，曹傲能，刘森，刘士勇，常智杰，王银银，程龙。

19.ZL 201410530672.3，一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的活性检测方法及其应用，2015.12.30。发明人：刘森，廖陈曾，王艳林，占景琼。

20.ZL 201410134532.4，肿瘤坏死因子-α转化酶的多肽抑制剂的筛选方法及其应用，2016.03.16。发明人：刘森，刘朝奇，刘松，张伟。

21.ZL 201410534410.4，一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用，2017.01.11。发明人：刘森，廖陈曾，王艳林。

22.ZL 201410532418.7，小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用，2016.06.01。发明人：刘森，廖陈曾，王艳林。

23.ZL 201410530674.2，一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋及其应用，2016.06.01。发明人：刘森，廖陈曾。

24.ZL 201410534409.1，一种小分子抑制剂及在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC)上的应用，2016.07.06。发明人：刘森，廖陈曾，王艳林。

25.ZL 201510057907.6，一种小分子抑制剂及其在抑制S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的应用，2016.09.07。发明人：刘森，廖陈曾，王艳林。

26.ZL 201410524151.7，一种小分子抑制剂及在抑制鸟氨酸脱羧酶上的应用，2017.02.15。发明人：刘森，王艳林，占景琼

27.ZL 201410525202.8，一种小分子抑制剂及在抑制鸟氨酸脱羧酶（ODC）上的应用，2017.06.06。发明人：刘森，王艳林，占景琼

28.ZL 201410524065.6，一种小分子抑制剂及其应用，2017.03.29。发明人：王艳林，刘森，占景琼